Con el objetivo de asesorar a la organización sobre aquellas cuestiones que se planteen para el mejor cumplimiento de sus fines, MUSOL (Municipalistas por la Solidaridad y el Fortalecimiento Institucional  ha creado una comisión asesora formada por expertos del mundo de la cooperación y el municipalismo.

Este grupo, constituido por más de 20 personas que colaboran de manera voluntaria, podrán por una parte asesorar puntualmente sobre las cuestiones técnicas, administrativas y de gestión que surjan y, por otra, constituir un grupo de reflexión para intercambiar opiniones sobre la línea de actuación y para abordar nuevas acciones y/o rectificar las iniciadas, prestando asistencias técnicas puntuales a los proyectos.

El órgano se reúne al menos una vez al año y siempre se intenta que participen en la Comisión personas de varias delegaciones territoriales, así como se busca siempre mantener equidad de género en los integrantes.