La Fundación MUSOL tiene sede central en Valencia y tiene delegaciones en otras comunidades autónomas y en el extranjero. En España, la fundación MUSOL se organiza territorialmente por comunidades autónomas y ciudades autónomas y dentro de estos ámbitos podrá hacerlo por provincia, municipio o por ámbitos territoriales homogéneos. Las funciones de las delegaciones en España incluyen, entre otras, dinamizar la participación en la vida institucional de las personas colaboradoras residentes en el territorio de la delegación e implementar acciones de promoción del desarrollo sostenible, comunicación y divulgación así como de sensibilización y educación para el desarrollo en el territorio de competencia.